4 départements :
Les activités de l'institut s'organisent au travers de 4 départements : la conservation-restauration, la conservation préventive, la formation et la recherche appliquée
Conservation-restauration 
L'atelier traite deux types de collections :
- objets d’art métalliques : orfèvrerie, sculpture, objets ethnologiques, objets techniques industriels, objets archéologiques
- objets en céramiques et en verre
Les interventions de conservation-restauration commencent par un constat d'état, un diagnostic et un projet de traitement adapté à la problématique. Il peut s'agir d'identification, de conservation, d'étude ou de présentation des objets.
Conservation préventive 
Les actions de conservation préventive relèvent :
- étude globale en conservation préventive,
- soclage, emballage, stabilisation,
- mise en place de plan de conservation préventive dans les institutions.
Recherche appliquée 
Les projets de recherche appliquée sont proposés au conseil scientifique de Conservare. S'ils sont validés et financés, un ingénieur de recherche peut conduire les travaux. Les travaux menés actuellement concernent les améliorations des conditions de conservation des collections notamment avec l'étude de corrosivité de l'air qui est en cours depuis 2006.
Formation 
L'équipe de Conservare assure une 50è de journées de formation qu'il s'agisse de formation :
- Professionnelle pour les personnels des musées et des services territoriaux
- Initiale en conservation-restauration, en gestion patrimoniale, en conservation préventive